Data Wrangling and Automated Reports from 'SIVIGILA' Source
Agrupar por área geográfica
Agrupar por columnas y casos
Agrupar por departamento y casos
Agrupar por edades, sexo y casos
Agrupar por edad y casos
Agrupar por tipo de enfermedad o evento
Agrupar por fecha de inicio de síntomas y casos
Agrupar por municipios y casos
Agrupar por la pertenencia étnica
Agrupar por rango de edad y casos
Agrupar por semana epidemiológica y casos
Agrupar por sexo, semana epidemiológica y casos
Agrupar por sexo y casos
Agrupar por la clasificación inicial del caso
Agrupar por área geográfica a nivel departamental o municipal
Agrupar por años de una enfermedad o evento
Calcular incidencia según distribución geográfica
Calcular incidencia por sexo
Calcular incidencia
Concatenar valores con separador o token
Convertir edad a años
Estandarizar códigos geográficos de los datos de una enfermedad o even...
Formatear código geográfico
Formatear fechas
Filtrar por departamentos y municipios
Importar los datos de una enfermedad o evento por año desde los microd...
Importar datos geográficos de Colombia
Importar la población para efectuar el cálculo de la incidencia
Importar las proyecciones DANE del año 2005 hasta el 2035
Importar la población a riesgo de un evento o enfermedad
Importar datos con un separador específico
Importar el Shapefile del mapa de Colombia
Limpiar datos de SIVIGILA
Limpiar las edades de los datos de una enfermedad o evento
Limpiar las etiquetas del encabezado
Limpiar fechas de los datos de una enfermedad o evento
Limpiar los valores atípicos de los datos
Importar enfermedades y años disponibles para su descarga desde los mi...
Obtener las condiciones para calcular la incidencia de una enfermedad ...
Obtener la configuración del mapa
Obtener código de un departamento y municipio
Obtener departamentos de Colombia
Obtener la estética de una escala para un gráfico de sivirep
Obtener los eventos relacionados
Obtener la fila con mayor número de casos
Obtener información geográfica de los datos de la enfermedad o evento
Obtener los meses con mayor número de casos
Obtener el nombre de un departamento de Colombia
Obtener el nombre de un municipio de Colombia
Obtener la población para efectuar el cálculo de la incidencia
Obtener la ruta de descarga de una enfermedad por un año específico
Obtener la ruta del directorio donde se almacenarán los datos del even...
Obtener el párrafo de la distribución de casos por sexo
Obtener columnas de ocurrencia geográfica de los datos de la enfermeda...
Obtener valor del archivo de configuración
Obtener el año de una enfermedad o evento
Generar gráfico de distribución de casos por área geográfica
Generar gráfico de distribución de casos por departamentos
Generar gráfico de distribución de casos por edad y sexo
Generar gráfico de distribución de casos por edad
Generar gráfico de distribución de casos por fecha de inicio de síntom...
Generar mapa
Generar gráfico de distribución de casos por municipios
Generar gráfico de distribución de casos por pertenencia étnica
Generar gráfico de distribución de casos por sexo y semana epidemiológ...
Generar gráfico de distribución de casos por sexo
Generar tabla con la incidencia
Generar tabla con la incidencia por sexo
Generar tabla con la distribución de casos por tipo de enfermedad o ev...
Generar gráfico de distribución de casos por la clasificación inicial ...
Generar gráfico de distribución de casos por la clasificación inicial ...
Generar gráfico de distribución de casos por área geográfica a nivel d...
Generar gráfico de distribución de casos por año
Eliminar fechas mayores que el valor de comparación
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sivirep: Data Wrangling and Automated Reports from 'SIVIGILA' Source
Tema sivirep
Data wrangling, pre-processing, and generating automated reports from Colombia's epidemiological surveillance system, 'SIVIGILA' <https://portalsivigila.ins.gov.co/>. It provides a customizable R Markdown template for analysis and automatic generation of epidemiological reports that can be adapted to local, regional, and national contexts. This tool offers a standardized and reproducible workflow that helps to reduce manual labor and potential errors in report generation, improving their efficiency and consistency.
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